Pra quem não sabe o que é Stop-Motion é as animações em que são frame-by-frame ou quadro-a-quadro ou cada imagem que passa é fotografada e ai alterada,essa têcnica também era usada em desenhos antigamente.

Primeiro você precisa ter as fotos e a história e tirar cada foto um pouco de movimento,logo depois te-lás no computador para animar.Existem vários programas que animam mas é tão fácil que até o Windows Movie Maker é possivél criar videos.
É Claro que para isso você precisa configurar-ló.

Vá em Ferramentas e Opções e terá essa guia abaixo.

Ali você pode modificar a duração da imagem (para efeito melhor eu recomendo 0,125s com até 0,50 sg de transição) Feito isso é só adicionar as imagens em ordem e ver como ficou sua animação Stop Motion.
Fiz uma para um trabalho do colégio,tirei as fotos em sequência (ai está o segredo para pouco trabalho na hora da animação,organização na hora das fotos) e joguei no Movie Maker, você pode ver minha Animação no Player Abaixo.